Nejat Eczacıbaşı, 5 Ocak 1913 tarihinde İzmir'de doğdu. İlkokul yıllarında keman eğitimi alarak sanatla erken yaşta tanıştı. Lise öğrenimini İstanbul Robert Kolej'de tamamladıktan sonra yükseköğrenimini kimya alanında sürdürdü. 1934 yılında Almanya'da lisans eğitimini tamamladı; Chicago Üniversitesi'nde yüksek lisans, Berlin Üniversitesi'nde doktora derecesi aldı.
Yurt dışında edindiği bilimsel eğitim, Türkiye'ye döndüğünde üretim ve sanayi alanında kullanacağı teknik birikimin temelini oluşturdu. Kimya ve eczacılık bilgisini girişimcilikle birleştirmesi, yalnız ticari bir şirket kurma hedefinden çok, Türkiye'de modern ilaç üretim kapasitesinin geliştirilmesine yönelik bir sanayi yaklaşımına dönüştü.